Hajdúch Marián M.D., Ph.D.
Akademický titul: Associate Professor
E-mail: marian.hajduch@upol.cz
Telefon: +420 585632082, +420 585632083
Skupiny: ÚMTM, LEM, PERSONÁL, VEDOUCÍ
O mně
Scientist and medical professional mainly involved in molecular and translational medicine (disease area oncology. rare and infectious diseases); long-term experience in project management; R&D and technology transfer activities, including the construction and management of large research infrastructures. Founding director of the Institute of Molecular and Translational Medicine, Palacky University in Olomouc, CZ. He has been involved as principal investigator, investigator or clinical site manager in 19 clinical trials; actively participated in the research and/or management of >50 national and international projects; established Cancer Research Czech Republic as a major charity to support cancer research in CZ; spin-off companies focused on manufacturing of molecular diagnostics, bioinformatics and drug development; leader/co-leader drug development initiatives with one registered drug on market, several products in clinical trials, >35 in vitro diagnostic products on market, several CE IVD certified. Former Chair of the Boards of National Director and current Czech National Director for European Translational Medicine Infrastructure (EATRIS-ERIC); participated in creation of national network for personalized medicine and cancer management policies. Published more than >350 papers, 21 books/chapters, >40 patents, >6700 SCI citations, H-index 41.
Journals
AminoBODIPY Conjugates for Targeted Drug Delivery Systems and Real-Time Monitoring of Drug Release. Molecular Pharmaceutics. 2021, 18(6), 2385-2396, ISSN: 1543-8384, PMID: 33961440,
Inhibitors of CA IX Enzyme Based on Polyhedral Boron Compounds. Chembiochem : a European Journal of Chemical Biology. 2021, 22(18), 2741-2761, ISSN: 1439-4227, PMID: 33939874,
Prevalence and genotype distribution of human papillomavirus in Czech non-vaccinated heterosexual couples. Virology Journal. 2021, 18(1), 80, ISSN: 1743-422X, PMID: 33858457,
Volná místa
10 Lékařská biologie
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in exhaled air condensate in patients with systemic or pulmonary disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Antitumor drugs targeting nucleic acid metabolism |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Bioinformatics processing of big data within clinical and preclinical studies |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Pavliš Petr Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 3 místa v prezenční nebo kombinované formě studia |
| Projekt: | Identification of molecular targets and mechanisms of resistance in antitumor drugs using cell biology and proteomics methods |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Physiology and pathophysiology of aging |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Voller Jiří Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Drug repurposing for treatment and prevention of diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 1 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 1 místo v prezenční formě studia |
| Projekt: | Drug development of small molecules |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Diagnostics and therapy of rare diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 3 místa v prezenční nebo kombinované formě studia |
| Projekt: | Genetic and epigenetic biomarkers of cancer diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Slavkovský Rastislav Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 3 místa v prezenční formě studia |
3 Biomarkery: Identifikace a validace
| Projekt: | Genetic and epigenetic biomarkers in cancer |
|---|---|
| Vedoucí: | Drábek Jiří Ph.D., Slavkovský Rastislav Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Klonální hematopoéza neurčitého potenciálu (CHIP) byla nedávno popsána jako častý jev spojený se stárnutím. Je charakterizována hromaděním somatických mutací v buňkách krvetvorného systému. Přestože se CHIP projevuje expanzí určitých buněčných klonů, tento stav není doprovázen žádnými morfologickými znaky hematologické neoplazie. Bylo však prokázáno, že výskyt klonální hematopoézy koreluje se zvýšenou celkovou mortalitou a s rizikem maligní transformace krvetvorných buněk i kardiovaskulárních onemocnění, jako je ischemická cévní mozková příhoda. Do jaké míry a jakými mechanismy klonální hematopoéza přispívá k rozvoji onemocnění, zůstává předmětem současného výzkumu. Hlavním cílem projektu bude určit hlavní buňky nesoucí somatické mutace CHIP a studovat jejich úlohu při vzniku a udržování aterosklerotických plátů, zejména těch, které se podílejí na vzniku cévní mozkové příhody. Zvláštní pozornost bude věnována srovnání fenotypu CHIP pozitivních a negativních buněk. Využívané buněčné modely zahrnují nejen různé typy leukocytů, ale také cirkulující progenitorové endoteliální buňky. Studie bude zahrnovat starší osoby s prokázanou přítomností CHIP (>65 let). Subjekty budou našimi klinickými spolupracovníky charakterizovány podle přítomnosti či nepřítomnosti ischemické cévní mozkové příhody a přítomnosti či nepřítomnosti stenózy karotid. Přítomnost somatických variant ve 38 vybraných genech spojených s CHIP bude u sledovaných subjektů testována v rámci naší výzkumné skupiny. Projekt bude využívat různé techniky včetně FACS, MACS, buněčných kultur, izolace DNA z malého množství buněk, vysoce citlivé sekvenační metody pro genotypizaci DNA umožňující detekci variant s alelickou frekvencí nižší než 1 %, přípravy sekvenačních knihoven DNA/RNA, hlubokého masivně paralelního sekvenování panelu genů s využitím unikátních molekulárních čárových kódů/indexů, RNAseq, bioinformatiky a analýzy dat s možností výpočtů na vysoce výkonném výpočetním clusteru, správy dat a statistického vyhodnocení. |
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in exhaled breath condensate in patients with systemic or pulmonary disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Téma doktorské práce je zaměřeno na identifikaci biomarkerů plicních onemocnění pomocí neinvazivního odběru kondenzátu vydechovaného vzduchu. Projekt bude sledovat přítomnost proteinů ve vydechovaném vzduchu u různých onemocnění, jako je astma, cystická fibróza, nádory plic nebo některá infekční onemocnění, a také kvantitativní změny těchto proteinů ve srovnání se zdravou populací. Změny těchto potenciálních biomarkerů ve vztahu k odpovědi na léčbu a progresi onemocnění budou vyhodnoceny a validovány. |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Rakovina je v západních zemích druhou nejčastější příčinou úmrtí. Včasná diagnostika a cílená terapie zlepšují výsledky léčby. Díky novým biotechnologiím lze diagnózu stanovit včas a přesně a znalost molekulární genetiky nádoru umožňuje zvolit nejvhodnější terapii pro konkrétního pacienta. Citlivost moderních molekulárních metod umožňuje charakterizovat vlastnosti nádoru z míst vzdálených od primárního nádoru, a to s využitím krve pacienta. Předmětem nabízeného studijního programu je identifikace nových prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění pomocí tekutých biopsií. Jde zejména o analýzu cirkulujících nádorových buněk (CTC), cirkulující volné nádorové DNA (ctDNA) a cirkulujících miRNA. Cílem projektu je dále zavádět koncept tekuté biopsie do diagnostiky a monitorování terapie solidních nádorů, zejména kolorektálního karcinomu, karcinomu prsu, plic a nádorů CNS. Patří sem monitorování odpovědi na léčbu a rezistence, identifikace nových terapeutických cílů a odhad prognózy onemocnění. Projekt poskytne školení v široce používaných a přenositelných technikách, včetně systému záchytu cirkulujících nádorových buněk, digitální kapénkové PCR, qPCR s reverzní transkripcí, RNA-seq, analýz jednotlivých buněk, xenograftových modelů a dalších multiomických metod. Hledáme uchazeče se vzděláním v oboru molekulární biologie, medicíny, buněčné biologie nebo v příbuzné oblasti, kteří mají zájem zkoumat nové přístupy v diagnostice nádorových onemocnění s významným potenciálem pro veřejné zdraví. |
1 Biomarkers: Identification and validation
| Projekt: | Identification of novel proteomic cancer biomarkers |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
1 Chemická biologie a experimentální terapie
| Projekt: | Pharmacokinetic methods in preclinical drug testing |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Lišková Barbora Ph.D. |
| K dispozici: | 1 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Studium vlastností ADME potenciálních léčiv, která jsou součástí chemické knihovny IMTM – získaných v rámci národní nebo mezinárodní spolupráce –, patří k prvním krokům při predikci potenciálních léčiv. Modely in vitro poskytují mnoho parametrů ADME, včetně chemické, plazmatické a mikrozomální stability, vazby na plazmatické proteiny a podílu pasivní difuze jako transportního mechanismu. Testy permeability Caco-2 a MDCK-MDR1 jsou zavedenými modely střevní a hematoencefalické bariéry. Analýza vzorků se provádí pomocí systému Agilent RapidFire 300 – rychlé online extrakce na pevné fázi s následnou detekcí na hmotnostním spektrometru Qtrap 5500 (AB Sciex) – RF/MS. Vysokokapacitní hmotnostně spektrometrický systém RF/MS poskytuje ultrarychlou analýzu nativních látek bez nutnosti značení pro biochemické testy ADME a dosahuje rychlosti 6 až 10 sekund na vzorek. |
3 Patofyziologie a nové cíle léků
| Projekt: | Identification of molecular targets of anticancer therapy applying cell biology and proteomics tools |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Vybrané vysoce aktivní deriváty triterpenů, chelátorů a nukleosidů budou studovány s cílem identifikovat mechanismy jejich protinádorových účinků. K jejich studiu budou využity pokročilé metody buněčné biologie, proteomiky a genomiky, jako je afinitní purifikace proteinových cílů, CETSA a další. Identifikované cíle budou validovány z hlediska jejich klinické relevance v protinádorové terapii. |
| Projekt: | Drug resistance mechanisms in cancer |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Budou studovány mechanismy rezistence nádorových buněk k nově vyvíjeným i stávajícím cytostatikům ze skupiny nukleosidových analog. Tato léčiva se používají ve většině protokolů protinádorové terapie a vznik lékové rezistence představuje zásadní problém v léčbě onkologických pacientů. Na dříve připravených rezistentních buněčných liniích budou identifikovány klíčové mechanismy rezistence, a to jejich podrobnou charakterizací metodami buněčné biologie, ale také proteomiky a molekulární genetiky. Význam identifikovaných změn bude dále ověřen na klinickém materiálu a bude uplatněn při vývoji nových protinádorových léčiv z této třídy. |
| Projekt: | Pathological conditions associated with human papillomavirus infection |
|---|---|
| Vedoucí: | Koudeláková Vladimíra Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Infekce vysoce rizikovými lidskými papilomaviry (HPV infekce) je spojena s několika typy nádorových onemocnění, jako jsou karcinomy děložního hrdla, pochvy, vulvy, hlavy a krku, anu a penisu. Téměř všechny nádory děložního hrdla jsou způsobeny infekcí HPV. Navzdory dostupnému očkování a screeningovému programu karcinomu děložního hrdla patří tento karcinom k nejčastějším typům nádorových onemocnění u žen na celém světě. Hlavními problémy screeningu karcinomu děložního hrdla jsou nízká účast a nízká senzitivita cytologie, která se stále používá ve většině screeningových programů. Řešením by mohl být přechod na primární HPV screening a zasílání souprav pro samoodběr ženám, které se screeningu neúčastní. V průběhu projektu bude analyzována nejlepší strategie pro zapojení českých žen do screeningového programu. Získané vzorky budou testovány na přítomnost HPV DNA a dalších molekulárních biomarkerů důležitých pro eliminaci viru a progresi/regresi karcinomu děložního hrdla. Zjištění povedou k identifikaci biomarkerů pro včasnou diagnostiku, progresi onemocnění nebo strategie třídění (triáže). Cílem projektu je objasnit nejlepší strategii pro zapojení žen, které se screeningového programu karcinomu děložního hrdla neúčastní. Druhým cílem je studovat genetický a proteomický profil HPV pozitivních/negativních žen s normální/abnormální cervikální cytologií a také genetické varianty HPV a jejich význam pro regresi/progresi onemocnění. Student si osvojí dovednosti z oblasti biochemie, molekulární biologie, bioinformatiky a práce s buněčnými kulturami. Jde o ideální projekt pro studenta, který chce pokračovat ve vyšším studiu v oblasti výzkumu rakoviny. Projekt bude využívat různé techniky včetně PCR, in situ hybridizace, sekvenování nové generace a hmotnostní spektrometrie. |
1 Pathophysiology and new drug targets
| Projekt: | Biology of aging and DNA damage |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 1 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
12 Molecular and Translational Medicine
| Projekt: | Identification of molecular targets and resistance mechanisms of anticancer drugs by cell biology and proteomics methods |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in exhaled breath condensate patients with systemic or pulmonary disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Bioinformatics processing of big data in clinical and preclinical studies |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Pavliš Petr Ph.D., Vrbková Jana Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Drug repurposing for treatment and prevention of diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Gurská Soňa Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Biologically active molecules and their therapeutic combinations |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Anticancer drugs targeting nucleic acid metabolism |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Synthesis and characterization of 2D nanoplatforms as active drug carriers |
|---|---|
| Vedoucí: | Ranc Václav Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Physiology and pathophysiology of ageing |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Voller Jiří Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Identification of proteomic biomarkers in proximal fluids and tissues |
|---|---|
| Vedoucí: | Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | New methods in protein degradation |
|---|---|
| Vedoucí: | Holub Dušan Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Research and development of agents for cancer, neurodegenerative and infectious diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | De Sanctis Juan Bautista Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Urban Milan Ph.D., Das Viswanath M.Sc., Ph.D. |
| K dispozici: | 5 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
| Projekt: | Genetic and epigenetic biomarkers in health and disease |
|---|---|
| Vedoucí: | Slavkovský Rastislav Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Drábek Jiří Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 5 |
| Určeno pro: | Doctoral training |
2 Molekulární a translační medicína
| Projekt: | Diagnosis and treatment of rare diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |