Výzkum se zaměřuje na zavádění komplexních genomických analýz tekuté biopsie (cirkulující nádorové buňky, cirkulující nádorová DNA, extracelulární vezikuly, volné cirkulující biomarkery) do diagnostiky, sledování a léčby onkologických pacientů. Minimální invazivita a možnost opakovaných odběrů tekuté biopsie poskytují přesné a aktuální informace o současném rozsahu onemocnění, účinku léčby nebo recidivě onemocnění, a umožňují tak cílenou léčbu ve správný čas. Členové skupiny se translačnímu výzkumu v oblasti tekuté biopsie nádorů věnují více než 15 let a zavedli několik diagnostických metod pro predikci diseminace a/nebo progrese nádorových onemocnění u člověka.
Genomika a cirkulující biomarkery
Laboratoř experimentální medicíny
Oblasti výzkumu
- Genomika nádorových onemocnění
- Genová exprese a její regulace u nádorů
- Tekutá biopsie
- Cirkulující nádorové buňky
- Vzácná onemocnění
Aktuální projekty
Optimalizace genomických metod v diagnostice nádorových onemocnění s využitím tekuté biopsie. Metodické postupy jsou zásadní pro práci s malým množstvím biologického materiálu a je třeba je optimalizovat. Zejména pro analýzu cirkulujících nádorových buněk a volné cirkulující nádorové DNA se jako klíčové pro vysokou kvalitu výsledků jeví kroky purifikace, amplifikace a přípravy knihoven. Validace nových cirkulujících biomarkerů. Hlavní oblastí výzkumu je identifikace a validace nových diagnostických, prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění s využitím neinvazivní tekuté biopsie. Skupina Dr. Srovnala se od roku 2005 zaměřuje na detekci cirkulujících nádorových buněk i plazmatických biomarkerů u kolorektálního karcinomu, karcinomu slinivky břišní, karcinomu prsu a karcinomu plic. V současnosti je v centru pozornosti vliv opioidních léčiv na diseminaci nádorů.
Vybrané publikace
Identification of Meningioma Patients at High Risk of Tumor Recurrence Using MicroRNA Profiling. Neurosurgery. 2020, 87(5), 1055-1063, ISSN: 0148-396X, PMID: 32125436,
Identification of Meningioma Patients at High Risk of Tumor Recurrence Using MicroRNA Profiling. Neurosurgery. 2020, 87(5), 1055-1063, ISSN: 0148-396X, PMID: 32125436,
Volná místa
6 Molekulární a translační medicína
| Projekt: | Liquid biopsies in experimental and clinical oncology |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Projekt: | Liquid biopsies in experimental and clinical oncology |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Projekt: | Diagnosis and treatment of rare diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Projekt: | Diagnosis and treatment of rare diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
4 Lékařská biologie
| Projekt: | Diagnostics and therapy of rare diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | Diagnostics and therapy of rare diseases |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 2 místa v prezenční formě studia |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 3 místa v prezenční nebo kombinované formě studia |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Srovnal Josef M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 3 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | 3 místa v prezenční nebo kombinované formě studia |
4 Biomarkery: Identifikace a validace
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Rakovina je v západních zemích druhou nejčastější příčinou úmrtí. Včasná diagnostika a cílená terapie zlepšují výsledky léčby. Díky novým biotechnologiím lze diagnózu stanovit včas a přesně a znalost molekulární genetiky nádoru umožňuje zvolit nejvhodnější terapii pro konkrétního pacienta. Citlivost moderních molekulárních metod umožňuje charakterizovat vlastnosti nádoru z míst vzdálených od primárního nádoru, a to s využitím krve pacienta. Předmětem nabízeného studijního programu je identifikace nových prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění pomocí tekutých biopsií. Jde zejména o analýzu cirkulujících nádorových buněk (CTC), cirkulující volné nádorové DNA (ctDNA) a cirkulujících miRNA. Cílem projektu je dále zavádět koncept tekuté biopsie do diagnostiky a monitorování terapie solidních nádorů, zejména kolorektálního karcinomu, karcinomu prsu, plic a nádorů CNS. Patří sem monitorování odpovědi na léčbu a rezistence, identifikace nových terapeutických cílů a odhad prognózy onemocnění. Projekt poskytne školení v široce používaných a přenositelných technikách, včetně systému záchytu cirkulujících nádorových buněk, digitální kapénkové PCR, qPCR s reverzní transkripcí, RNA-seq, analýz jednotlivých buněk, xenograftových modelů a dalších multiomických metod. Hledáme uchazeče se vzděláním v oboru molekulární biologie, medicíny, buněčné biologie nebo v příbuzné oblasti, kteří mají zájem zkoumat nové přístupy v diagnostice nádorových onemocnění s významným potenciálem pro veřejné zdraví. |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Rakovina je v západních zemích druhou nejčastější příčinou úmrtí. Včasná diagnostika a cílená terapie zlepšují výsledky léčby. Díky novým biotechnologiím lze diagnózu stanovit včas a přesně a znalost molekulární genetiky nádoru umožňuje zvolit nejvhodnější terapii pro konkrétního pacienta. Citlivost moderních molekulárních metod umožňuje charakterizovat vlastnosti nádoru z míst vzdálených od primárního nádoru, a to s využitím krve pacienta. Předmětem nabízeného studijního programu je identifikace nových prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění pomocí tekutých biopsií. Jde zejména o analýzu cirkulujících nádorových buněk (CTC), cirkulující volné nádorové DNA (ctDNA) a cirkulujících miRNA. Cílem projektu je dále zavádět koncept tekuté biopsie do diagnostiky a monitorování terapie solidních nádorů, zejména kolorektálního karcinomu, karcinomu prsu, plic a nádorů CNS. Patří sem monitorování odpovědi na léčbu a rezistence, identifikace nových terapeutických cílů a odhad prognózy onemocnění. Projekt poskytne školení v široce používaných a přenositelných technikách, včetně systému záchytu cirkulujících nádorových buněk, digitální kapénkové PCR, qPCR s reverzní transkripcí, RNA-seq, analýz jednotlivých buněk, xenograftových modelů a dalších multiomických metod. Hledáme uchazeče se vzděláním v oboru molekulární biologie, medicíny, buněčné biologie nebo v příbuzné oblasti, kteří mají zájem zkoumat nové přístupy v diagnostice nádorových onemocnění s významným potenciálem pro veřejné zdraví. |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Rakovina je v západních zemích druhou nejčastější příčinou úmrtí. Včasná diagnostika a cílená terapie zlepšují výsledky léčby. Díky novým biotechnologiím lze diagnózu stanovit včas a přesně a znalost molekulární genetiky nádoru umožňuje zvolit nejvhodnější terapii pro konkrétního pacienta. Citlivost moderních molekulárních metod umožňuje charakterizovat vlastnosti nádoru z míst vzdálených od primárního nádoru, a to s využitím krve pacienta. Předmětem nabízeného studijního programu je identifikace nových prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění pomocí tekutých biopsií. Jde zejména o analýzu cirkulujících nádorových buněk (CTC), cirkulující volné nádorové DNA (ctDNA) a cirkulujících miRNA. Cílem projektu je dále zavádět koncept tekuté biopsie do diagnostiky a monitorování terapie solidních nádorů, zejména kolorektálního karcinomu, karcinomu prsu, plic a nádorů CNS. Patří sem monitorování odpovědi na léčbu a rezistence, identifikace nových terapeutických cílů a odhad prognózy onemocnění. Projekt poskytne školení v široce používaných a přenositelných technikách, včetně systému záchytu cirkulujících nádorových buněk, digitální kapénkové PCR, qPCR s reverzní transkripcí, RNA-seq, analýz jednotlivých buněk, xenograftových modelů a dalších multiomických metod. Hledáme uchazeče se vzděláním v oboru molekulární biologie, medicíny, buněčné biologie nebo v příbuzné oblasti, kteří mají zájem zkoumat nové přístupy v diagnostice nádorových onemocnění s významným potenciálem pro veřejné zdraví. |
| Projekt: | New prognostic and predictive factors in solid tumors |
|---|---|
| Vedoucí: | Srovnal Josef M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D. |
| K dispozici: | 2 |
| Určeno pro: | Doktorské studium |
| Souhrn: | Rakovina je v západních zemích druhou nejčastější příčinou úmrtí. Včasná diagnostika a cílená terapie zlepšují výsledky léčby. Díky novým biotechnologiím lze diagnózu stanovit včas a přesně a znalost molekulární genetiky nádoru umožňuje zvolit nejvhodnější terapii pro konkrétního pacienta. Citlivost moderních molekulárních metod umožňuje charakterizovat vlastnosti nádoru z míst vzdálených od primárního nádoru, a to s využitím krve pacienta. Předmětem nabízeného studijního programu je identifikace nových prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění pomocí tekutých biopsií. Jde zejména o analýzu cirkulujících nádorových buněk (CTC), cirkulující volné nádorové DNA (ctDNA) a cirkulujících miRNA. Cílem projektu je dále zavádět koncept tekuté biopsie do diagnostiky a monitorování terapie solidních nádorů, zejména kolorektálního karcinomu, karcinomu prsu, plic a nádorů CNS. Patří sem monitorování odpovědi na léčbu a rezistence, identifikace nových terapeutických cílů a odhad prognózy onemocnění. Projekt poskytne školení v široce používaných a přenositelných technikách, včetně systému záchytu cirkulujících nádorových buněk, digitální kapénkové PCR, qPCR s reverzní transkripcí, RNA-seq, analýz jednotlivých buněk, xenograftových modelů a dalších multiomických metod. Hledáme uchazeče se vzděláním v oboru molekulární biologie, medicíny, buněčné biologie nebo v příbuzné oblasti, kteří mají zájem zkoumat nové přístupy v diagnostice nádorových onemocnění s významným potenciálem pro veřejné zdraví. |