EATRIS-CZ nabízí přístup k platformě pro vysokokapacitní screening a vysokoobsahovou analýzu – jedné z největších akademických instalací na světě, která poskytuje screeningová a velkoobjemová biologická data z široké škály testů a detekčních systémů. Popisovaná platforma HTS má průmyslové parametry, je modulární a flexibilní a umožňuje testování v prostředí BSL3 a BSL2+, screening v kombinaci s ionizujícím zářením (rentgenovým zářením), hmotnostní spektrometrií, vysokoobsahovou analýzou a dalšími metodami. Screeningové testy poskytují kandidátní látky (leads) pro navazující výzkum a vývoj léčiv.
Screeningová platforma HTS/HCA je založena na nejmodernějším robotickém systému od společnosti HighResBiosolutions Ltd. Systém se skládá ze tří robotických ramen, automatických inkubátorů, pipetovacích automatů pro mikrolitrové a nanolitrové objemy, zatavovaček, odtavovaček, centrifug a readerů pro fluorescenci, luminiscenci, absorbanci a ionizující záření. Součástí systému jsou také širokoúhlé konfokální mikroskopy a konfokální mikroskopy s rotujícím diskem (Operetta, Yokogawa CV7000) vybavené softwarovými nástroji pro analýzu obrazu a vyhodnocení dat. Klíčovou součástí robotického systému je automatizovaná chemická knihovna obsahující více než 110 000 sloučenin.
Podpora projektů výzkumu a vývoje léčiv
V oblasti uHTS/HCA a chemické biologie/genetiky nabízí EATRIS-CZ spolupráci na kolaborativních i smluvních projektech výzkumu a vývoje, včetně testování biologické aktivity malých molekul.
Dostupné testy se zaměřují na
- Cytotoxicitu (nenádorové/nádorové a rezistentní buněčné linie)
- Primární lidské zdravé a nemocné buňky
- Analýzu buněčného cyklu (fixované i živé buňky)
- Fenotypové screeningy s využitím HCA
- Modulaci/integritu cytoskeletu
- Syntézu DNA, RNA a proteinů
- Poškození/opravu DNA, screening v kombinaci s rentgenovým zářením
- Interakce protein–protein a protein–nukleové kyseliny
- Aktivitu receptorů spřažených s G-proteiny (adenosinové, kanabinoidní a opioidní receptory)
- Test toku intracelulárního vápníku
- Produkci cAMP při modulaci aktivity adenylátcyklázy receptory spřaženými s G-proteiny
- Mapování nejvýznamnějších signálních drah (např. Hedgehog, Wnt, p53, KRAS, RAGE) pomocí fosforylačních a reportérových
- testů
- Screening demetylačních látek s využitím vlastní buněčné linie
- Biochemické testy na míru
- Antimikrobiální aktivitu u G+/G- kmenů včetně bakterií rezistentních vůči léčivům, kmenů mykobakterií, kvasinek, vláknitých hub,
- virů a parazitů v podmínkách BSL2 a BSL3
- Buněčné 3D kultivační modely (cytotoxicita, reportérové studie apod.)
Další služby
Vývoj a validace homogenních testů typu mix-and-measure (ve formátu 384 a 1536 jamek) v úzké spolupráci s uživateli pro:
- Absorbanci
- Luminiscenci
- Fluorescenční polarizaci
- Intenzitu fluorescence
- Fluorescenční rezonanční přenos energie (FRET), ALPHA-Screen, LANCE
- Časově rozlišenou fluorescenci (TRF)
- High Content Screening
- Identifikace nového molekulárního cíle nebo nového přístupu k testování
- Validace testu na chemických knihovnách dodaných zákazníkem nebo komerčních (Lopac1280, Prestwick, Enzo)
- Podpora při analýze dat HCS
- Skripty na míru pro analýzu obrazu v programech Columbus, Acapella, MathLab a ImageJ
- Dostupnost širokého spektra reportérových buněčných linií
- Profilování hitů a kandidátních látek (Hit and Lead profiling) a preklinický vývoj vybraných kandidátních léčiv