Přejít k hlavnímu obsahu

Laboratoř integrity genomu

Výzkum v Laboratoři integrity genomu (LIG) se zaměřuje na objasnění molekulárních mechanismů, které řídí odpověď na poškození DNA a dráhy buněčného stresu. Tyto dráhy jsou aktivovány řadou faktorů, mezi něž patří mimo jiné chybná replikace DNA, proteotoxicita, mechanické namáhání a oxidační poškození. Jsou klíčové pro přežívání nádorových buněk a hrají zásadní roli ve vzniku rezistence k léčbě.

Náš výzkum zahrnuje širokou škálu charakteristických znaků nádorových buněk, jako je zvýšená míra poškození DNA spojená s mutační zátěží, narušená přesnost replikace DNA, hromadění chybně složených či nefunkčních proteinů, tvorba volných radikálů, nedostatek živin a hypoxie. Prostřednictvím našich specializovaných metod a odborných znalostí se snažíme tyto stresové dráhy přímo zkoumat a cílit na ně v prostředí nádorových buněk.

Přínos našeho výzkumu je mnohostranný – od objevování nových prediktivních markerů přes optimalizaci stávajících protinádorových léčebných režimů až po identifikaci inovativních terapeutických cílů. Pro dosažení těchto cílů se laboratoř člení na dvě hlavní výzkumné větve:

Skupina „Buněčný stres“, vedená Dr. Martinem Mistríkem, se zaměřuje na objasnění složitosti buněčných stresových odpovědí a jejich úlohy v patologii nádorových onemocnění.

Skupina „Dynamika replikace DNA“, vedená Dr. Pavlem Moudrým, se specializuje na zkoumání detailů procesů replikace DNA, zejména v kontextu zhoubných nádorů.

Oblasti výzkumu
  • Poškození a oprava DNA a genomová nestabilita
  • Proteotoxický stres a proteostáza
  • Mechanický stres
  • Onkogenní stres a stres způsobený volnými radikály
  • Replikace DNA a replikační stres
  • Enzym PARP a cílení na něj
Vybrané publikace
CHROMÁ, K., Z. ŠKROTT, J. GURSKÝ, J. BACOVSKY, P. MOUDRÝ, T. BUCHTOVÁ, M. MISTRÍK, J. BÁRTEK
A drug repurposing strategy for overcoming human multiple myeloma resistance to standard-of-care treatment. Cell Death & Disease. 2022, 13(3), 203, ISSN: 2041-4889, PMID: 35246527,
MOUDRÝ, P., K. CHROMÁ, S. BURSAC, S. VOLAREVIC, J. BÁRTEK
RNA-interference screen for p53 regulators unveils a role of WDR75 in ribosome biogenesis. Cell Death and Differentiation. 2022, 29(3), 687-696, ISSN: 1350-9047, PMID: 34611297,
MOUDRÝ, P., K. CHROMÁ, S. BURSAC, S. VOLAREVIC, J. BÁRTEK
RNA-interference screen for p53 regulators unveils a role of WDR75 in ribosome biogenesis. Cell Death and Differentiation. 2022, 29(3), 687-696, ISSN: 1350-9047, PMID: 34611297,
Patenty
MOLECULAR COMPLEX ASSEMBLY PARTICLES COMRISING BIS-R1, R2-DITHIOCARBAMATE-METAL COMPLEX AND A LIGAND, METHOD OF PREPARATION AND USE THEREOF "DISULFIRAM II" (Mistrík)
  1. Published Application EP 18199181.1 under EP 3636285 (15.4.2020)
  2. Published Application PCT/EP2019/077222 under WO 2020/074514 (16.4.2020)
  3. Patent: AU 2019358428. Granted: 4.8.2022. Ownership: Palacky University Olomouc. Inventors: Mistrík Martin, Bártek Jiří, Škrott Zdeněk, Džubák Petr, Hajdúch Marián
  4. Patent: JP 7220932. Granted: 3.2.2023. Ownership: Palacky University Olomouc. Inventors: Mistrík Martin, Bártek Jiří, Škrott Zdeněk, Džubák Petr, Hajdúch Marián

Status: Patents pending, Available

MCOPPB FOR USE AS MEDICAMENT (Mistrík)
  1. Published Application EP 18166780.9 under EP 3552605 (16.10.2019)
  2. Published Application PCT/CZ2019/059320 under WO 2019/197564 (17.10.2019)

Status: Patent pending, Available

BIOAVAILABLE DITHIOCARBAMATE-METAL COMPLEX NANOPARTICLES, METHOD OF PREPARATION AND USE THEREOF "DISULFIRAM I" (Škrott)
  1. Patent: EP 3459526. Granted: 24.2.2021. Ownership: Palacky University, Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
  2. Published Application PCT/EP2018/076098 under WO 2019/063601 (4.4.2019)
  3. Patent: AU 2018340510. Granted: 5.8.2021. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
  4. Patent: CA 3,076,855. Granted: 26.4.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
  5. Patent: KR 10-2456683. Granted: 14.10.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
  6. Patent: JP 2020-537873. Granted: 29.9.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.
  7. Patent: MX 396,552. Granted: 17.10.2022. Ownership: Palacký University Olomouc. Inventors: Škrott Zdeněk, Mistrík Martin, Hajdúch Marián, Bártek Jiří, Džubák Petr, Zbořil Radek.

Status: Available

Volná místa
1 Molecular and Translational Medicine
Projekt: Cellular stress in health and disease
Vedoucí: Mistrík Martin Ph.D., Moudrý Pavel Ph.D., Škrott Zdeněk Ph.D.
K dispozici: 3
Určeno pro: Doctoral training
1 Lékařská biologie
Projekt: DNA damage signaling in the cellular response to stress
Vedoucí: Mistrík Martin Ph.D.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doktorské studium
Souhrn: 1 místo v prezenční formě studia
2 Patofyziologie a nové cíle léků
Projekt: Study of DNA double-strand break repair in tumor model
Vedoucí: Mistrík Martin Ph.D.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doktorské studium
Souhrn: Takzvané dvouřetězcové zlomy (DSB) jsou nejletálnějšími lézemi DNA, které mohou být významným zdrojem mutací, a stát se tak počátkem nevratných genetických změn vedoucích k degenerativním onemocněním včetně rakoviny. Zároveň se indukce DSB zavedená ve vhodném uspořádání může stát pro buňky neřešitelným problémem, zejména v určitých genetických kontextech typických pro nádory, což je východiskem celé řady strategií léčby rakoviny. Způsob, jakým se buňky s DSB vypořádávají, je proto předmětem velkého zájmu současného lékařského a biologického výzkumu. Doktorand/ka si osvojí několik metod indukce DSB pomocí různých zdrojů, jako je záření gama, částice alfa, UV světlo a různé chemické induktory. Následně budou studovány molekulární mechanismy, jimiž se buňka s tímto typem poškození DNA vypořádává. Důraz bude kladen na rozdíly mezi normálními a nádorovými buňkami a na jejich potenciální využití v protinádorové terapii. Student se také naučí řadu laboratorních technik včetně práce s buněčnými kulturami, transfekcí RNA/DNA, pokročilých mikroskopických technik, zobrazování živých buněk a různých biochemických analýz proteinů.
Projekt: Signaling DNA damage in cellular response to stress
Vedoucí: Mistrík Martin Ph.D.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doktorské studium
Souhrn: Naše DNA je neustále ohrožována látkami, které ji poškozují. Neopravené poškození DNA může vést k chybám při zdvojování genomu, včetně mutací, které mohou vést ke vzniku rakoviny, a přispívat ke stárnutí a dalším lidským onemocněním. Buňky si vyvinuly propracované opravné mechanismy, které toto poškození odstraňují a zajišťují věrnou replikaci genetické informace, a my bychom tyto opravné mechanismy chtěli pochopit na molekulární úrovni. Naším konečným cílem je úplné molekulární a buněčné pochopení klíčových drah opravy DNA, které působí na poškození DNA. Doktorand/ka si osvojí řadu molekulárních a buněčných technik, včetně práce s buněčnými kulturami, RNA interference, imunofluorescenční mikroskopie, zobrazování živých buněk a imunoprecipitace proteinů. Naučí se také nové a účinné techniky, jako je superrezoluční mikroskopie a purifikace proteinů na nově syntetizované DNA.