Cílem tohoto projektu je vývoj a experimentální validace nových chemoinformatických nástrojů, které pomohou zvýšit úspěšnost primárního biologického screeningu s ohledem na molekulární aktivitu, vedlejší aktivitu a metabolickou stabilitu. Projekt sleduje čtyři hlavní směry: • Vývoj nástrojů pro výběr rozmanitých knihoven látek bez učitele (unsupervised) pro obecný vysokokapacitní screening založený na vizualizaci datových souborů s využitím pokročilých technik redukce dimenzionality a 2D molekulární reprezentace a na reprezentaci molekul pomocí 3D farmakoforů, • Vývoj nástrojů pro tvorbu cílených sad látek potenciálně účinných proti konkrétnímu cíli pomocí dvou strategií: - výběr látek z dostupných knihoven na základě 3D farmakoforů odvozených od ligandu a od struktury, - generování virtuálních cílených knihoven enumerací náhrad fragmentů výchozí látky (látek) vedoucích k požadované změně účinnosti. Přístup využije párové molekulární dvojice (Matched Molecular Pairs) pro enumeraci možných náhrad fragmentů a techniky strojového učení pro predikci změny účinnosti, • Vývoj nástrojů pro predikci látek s nežádoucím farmakologickým profilem (vysoká promiskuita, aktivita mimo cíl) a chemicky nestabilních látek s cílem vyřadit je ze screeningu, • Validace vyvinutých přístupů v retrospektivních studiích a jejich uplatnění v reálných projektech návrhu léčiv zaměřených na vývoj inhibitorů MARK4, ligandů kanabinoidního receptoru CB1 a ligandů adenosinových receptorů.
